Электронная библиотека диссертаций и авторефератов России
dslib.net
Библиотека диссертаций
Навигация
Каталог диссертаций России
Англоязычные диссертации
Диссертации бесплатно
Предстоящие защиты
Рецензии на автореферат
Отчисления авторам
Мой кабинет
Заказы: забрать, оплатить
Мой личный счет
Мой профиль
Мой авторский профиль
Подписки на рассылки



расширенный поиск

Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Габдулхаков Азат Габдрахманович

Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому
<
Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому
>

Диссертация - 480 руб., доставка 10 минут, круглосуточно, без выходных и праздников

Автореферат - бесплатно, доставка 10 минут, круглосуточно, без выходных и праздников

Габдулхаков Азат Габдрахманович. Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому : Дис. ... канд. физ.-мат. наук : 03.00.02 : Пущино, 2005 98 c. РГБ ОД, 61:05-1/1081

Содержание к диссертации

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ 4

ВВЕДЕНИЕ 5

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 7

1.1 Каталитические А-субъединицы белков, инактивирующих рибосому. 7

  1. Структура и ферментативная активность А-субъединицы рицина 7

  2. Моделирование ингибирования каталитической активности А-субъединицы 14

  3. Структура и ферментативная активность А-субъединицы абрина 20

  4. Структура и ферментативная активность А-субъединицы эбулина 21

  5. Рибосом-инактивирующие белки первого типа 22

  1. Антивирусный белок лаконоса (PAP). 23

  2. Трихосантин 27

  1. Бриодин 33

  2. Сапорин 33

1.2. Траспортная В-субъединица рибосом-инактивирующиех белков второго типа 37

  1. Структура и углевод-связывающая активность В-субъединицы рицина 3 8

  2. Структура и углевод-связывающая активность В-субъединицы абрина 41 1.2.3 Структура и углевод-связывающая активность В-субъединицы эбулина 41

1.3. Особенности внутриклеточного транспорта рибосом- инактивирующих
белков второго типа. Роль структурных особенностей данных белков при транспорте
внутри клетки 43
1.3.1 Интернетизация токсина 43

  1. Транспорт в эндосомальном компартменте 43

  2. Транспорт в аппарат Гольджи 44

  3. Ретроградный транспорт в эндоплазматический ретикулум. 44

  4. Транслокация токсина 45 ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 47

  1. Выделение и очистка агглютинина 47

  2. Кристаллизация агглютинина в комплексе с jS-D-галактозой 47

2.3. Сбор дифракционных данных с кристаллов агглютинина

  1. Выделение вискумина из Viscum album

  2. Кристаллизация вискумина и его комплексов

  3. Сбор дифракционных данных с кристаллов вискумина и его комплексов ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

  1. Решение проблемы фаз для агглютинина

  2. Определение и уточнение структуры агглютинина

  1. Укладка полипептидной цепи агглютинина

  2. Структура А-субъединицы агглютинина

3.5 Активный центр А-субъединицы агглютинина 3.6. Структура В-субъединицы агглютинина

  1. Первый галактозо-связывающий центр агглютинина

  2. Второй галактозо-связывающий центр агглютинина 3.9. Межсубъединичные контакты агглютинина

  1. Решение проблемы фаз для вискумина

  2. Определение и уточнение структуры вискумина и его комплексов

  1. Структура А-субъединицы вискумина

  2. Активный центр А-субъединицы вискумина

  3. Структура В-субъединицы вискумина

  4. Первый галактозо - связывающий центр вискумина

  5. Второй галактозо - связывающий центр вискумина

  1. Взаимодействие рибосом-инактивирующих белков с сарцин-рициновой рибосомы

  2. Четвертичная структура агглютинина и вискумина. ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

*

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ

АО. - аминокислотный остаток

АГ - аппарат Гольджи

ЛД50 - молярная концентрация ферментативной субъединицы в

составе цитотоксического агента, при которой наблюдается

гибель 50% клеток
КИ50 - молярная концентрация цитотоксического агента, при которой

наблюдается 50% ингибирование включения в клетки [ Н]

тимидина или [' С]лейцина
< РИБ - рибосом-инактивирующие белки

РИБ-І - рибосом-инактивирующие-белки первого типа, содержащие

одну субъединицу

РИБ-П - рибосом-инактивирующие белки второго типа, содержащие две

субъединицы

ЭПР - эндоплазматический ретикулум

МЫ - вискумин - mistletoe lectin I токсин из омелы I

MLII - mistletoe lectin II, токсин из омелы II

MLIII - mistletoe lectin III, токсин из омелы III

MLA - А-субъединица вискумина

MLB - В-субъединица вискумина

Ф RTA - А-субъединица рицина

RTB - В-субъединица рицина

S06 -сапорин

,>

Введение к работе

Одним из наиболее важных направлений развития новых биотехнологий является создание фармакологических препаратов, обладающих высокой специфичностью действия на клетки или молекулы-мишени в организме. В настоящее время именно белки или их конъюгаты привлекают особый интерес исследователей при конструировании высокоселективных лекарств. Активно изучаются с этой точки зрения растительные токсины, которые полностью останавливают синтез белка в клетке, переводя рибосомы в неактивное состояние. Эти токсины носят общее название рибосом-инактивирующих белков (РИБ).

Рибосом-инактивирующие белки разделяются на два типа: РИБ-І, которые состоят только из одной каталитической (active, А), субъединицы и РИБ-П, которые содержат как каталитическую (А), так и связывающую (binding, В) субъединицы [Barbieri et al., 1993]. А-субъединица обеспечивает инактивацию рибосомы, связываясь со специфическим участком (сарцин-рициновой петлей) 28S рРНК рибосомы эукариот и выщепляя аденин. Поскольку модифицированная таким образом рибосома теряет сродство к фактору элонгации транскрипции, это приводит к остановке синтеза белка клеткой и в результате к гибели клетки [Lord et al., 1991]. В-субъединица, являясь лектином, связывается с гликозилированными рецепторами на поверхности клетки и обеспечивает проникновение токсина в клетку. Высокая цитотоксическая активность РИБ-П является основной причиной использования их для создания иммуннотоксинов - лекарств нового поколения, главным образом противоопухолевого действия.

Помимо цитотоксических свойств белки этой группы проявляют в различной степени способность агглютинировать клетки за счет своей лектиновой активности. Кроме того, некоторые из них обладают и иммуномодулирующими свойствами.

Аминокислотные остатки, входящие в каталитический центр А-субъединиц, являются консервативными среди данного семейства; во многом сходно и

строение углевод-связывающих центров В-субъединиц. Однако, эффективность цитотоксического действия различных белков этого класса существенно различается. Сравнительный анализ структурных и функциональных свойств родственных рибосом-инактивирующих белков - один из эффективных подходов к выяснению механизмов, определяющих различия в их биологической активности. Понимание структурных особенностей, влияющих на цитотоксическую активность данных белков, необходимо также для получения эффективных препаратов иммунотоксинов на их основе.

Целью данной работы является определение пространственных структур тетрамерных рибосом-инактивирующих белков второго типа - вискумина (ML-I) из Viscum Album и агглютинина из Ricinus communis - и выявление структурных особенностей, влияющих на биологическую активность данных белков.

Похожие диссертации на Определение и анализ структур агглютинина из Ricinus communis и вискумина (ML-1) из viscum album-белков, инактивирующих рибосому