Введение к работе
В заключении приведена и основные выводы по результатам диссертационной работы.
В приложении приведены выравнивания аминокислотных и нуклеотидных последовательностей, использованных в данной работе.
На зашиту выносятся;
-  Новый подход к восстановлению и анализу относительных темпов нуклеотидных и аминокислотных замен вдоль выравнивания последовательностей с применением Фурье-разложения:, вэйвлет-разложения и Марковских цепей в сочетании со случайным выбором параметров; методы, разработанные в рамках предложенного подхода; их программная реализация. 
-  Результаты применения разработанных методов к реальным биологическим данным: иммуноглобулинам человека и генам алкогольдегидрогеназы дрозофилид. 
-  Новый метод восстановления мутационных спектров белков и его программная реализация. 
-  Результаты применения метода к реальным биологическим данным: последовательностям генов Р53, прионов и семейства цнтохромов Р450. 











