Электронная библиотека диссертаций и авторефератов России
dslib.net
Библиотека диссертаций
Навигация
Каталог диссертаций России
Англоязычные диссертации
Диссертации бесплатно
Предстоящие защиты
Рецензии на автореферат
Отчисления авторам
Мой кабинет
Заказы: забрать, оплатить
Мой личный счет
Мой профиль
Мой авторский профиль
Подписки на рассылки



расширенный поиск

Генетическая дифференциация штаммов Aureobasidium pullulans (de Bary) Arnaud, 1910 методом полимеразной цепной реакци Мокроусов, Игорь Владиславович

Данная диссертационная работа должна поступить в библиотеки в ближайшее время
Уведомить о поступлении

Диссертация, - 480 руб., доставка 1-3 часа, с 10-19 (Московское время), кроме воскресенья

Автореферат - бесплатно, доставка 10 минут, круглосуточно, без выходных и праздников

Мокроусов, Игорь Владиславович. Генетическая дифференциация штаммов Aureobasidium pullulans (de Bary) Arnaud, 1910 методом полимеразной цепной реакци : автореферат дис. ... кандидата биологических наук : 03.00.07.- Санкт-Петербург, 1993.- 24 с.: ил.

Введение к работе

Актуальность проблемы. Сложность таксономического анализа грибов обусловлена значительной изменчивостью широко используемых морфологических и биохимических признаков. Особенно неясна систематика дейторомицетов - искусственной группы грибов, объединенных по признаку отсутствия полового процесса. В этой связи оказывается неприменимым основной критерий биологического вида -скрещиваемость родительских культур-и фертильность потомстпа. Однако,, природные системы - биологические виды у дейтерошщетов существуют к могут быть выявлены на основе анализа ДІЙ. Благодаря новому ынтоду изучения геномов - полимеразной цепной реакции с угашероальшши прайшэраш /УП-ПЦР//Булат и др., 1989/ - удается амплифицировать in vitro фрагменты из множества локусав генома, которые поело разделения в голе представляют специфические ПЦР-паттерны» Перекрестная блот-гибридизация амплифицироваиной ДНК показывает ее гомологию и, выявляя таким образом генетическое единство штаммов, предлагается авторами метода в качество наи-. более общего критерїія биологического вида.

Рибосомная ДНК является давко известным эволюциошгым маркером. В последние года, применение универсальных для грибов рДНК-прай-меров позволяет амплифкцировать фрагменты рДНК ранее не изучавшихся грибоа для последующего филогенетического анализа.

Auraobaaidiun - дрояжеподобнкэ грибы, таксономия которых недостаточно ясна: выделяют от І / віііа,І97І/ до 14 видов / Heraasidan-llijhof ,1977/, составляв::; этот род, основываясь подчас на малых морфологических ила апологических различиях. Геном этих грибов остается попти неизученным. В этой связи было актуально пркмзшіть гфитерпЗ рДНК и мотод УП-ПЦР для изучения генетической изменчивости штаммов д.рііліііаг-з , имеющего прак-гичеехгуя :»t iiFoc'-j. п качестве продуцента биологически активнкх

Цель и задачи исследования. Цель работы заключалась в генетической дифференциации штаммов A.pullulana методом полимеразной цепной реакции геномной ДНК, Конкретные задачи были следующими: I,изучить изменчивость ачшшфицированной рДНК{ 2.провести филогенетический анализ штаммов A.pullulana на основе рДНК-подиморфизма компьютерными методами; 3.дифференцировать биологические виды Aureobaaidiura методом УП-ПЦР; 4.изучить генетическу» изменчивость

штаммов методом УП-ПЦР.

Научная новизна и практическая ценность работы. Подтверждена пригодность метода УП-ПЦР для генетической дифференциации биологических видов: на примере такономического вида A.pullulana показано, что гомология амплифу '.ированной с универсальными примерами ДНК, отражая генетическое единство штаммов, может служить наиболее общим критерием биологического вида, пригодным и для агамных организмов.

Впервые проведен филогенетический анализ штаммов A.pullulana основанный на компьютерной обработке рестрякционного рДНК-поли-мор|)изма с помощью пакета pihlip 3.3.

Показан сборный характер A.pullulana , включающего, по крайней мере, три самостоятельных биологических вида Aureobaoidium. Пять штаммов A.pullulana переопределено как Homioneaa пр.. Предложено использовать негативную КзаІ- рестрикцию изученного фрагмента рДНК для диагноза таксономического вида A.pullulana. Для быстрого корректного филогенетического анализа штаммов. Auroobaaldiun на основе рДНК предложено использовать две рест-риктазы - Alul и lispl.

Положения, выносимые на защиту. I.Подтверждение пригодности метода УП-ПЦР для идентификации биологических видов и дифференциации, штаммов грибов poflaAureobaoldluia . 2.Доказатзльство применимости компьютерных методов для филогенетического анализа

A.pullulano на основа рДНК-полиморфизма. З,Обоснование на основа УП-ПЦР дивергентного состояния двух биологических видов, входящих В таксономический вид A.pullul^a.

Апробация работы. Материалы диссертации были доложены на 15 Меядународном специализированной симпозиуме по дрожкам /Рига,1991/ и на заседаниях С.-Петербургского общества микробиологов и эпидемиологов /13,X.1992/ и кафедры микробиологии СПбХМ.

.Структура и объем диссертации» Диссертация состоит из введения, обзора литературы по теме исследования /3 главы/, экспериментального раздела, включаетцэго результаты собственных исследований и материала и методы /3 главы/, обсуждения полученных результатов и выводов.