Введение к работе
Актуальность проблемы
Псориаз - заболевание кожи, и болезнь Крона - заболевание эпителия кишечника, являются сложными генетически обусловленными патологиями, в проявлении которых задействованы большие группы (сети) взаимодействующих генов/белков При обеих патологиях страдает иммунная система (заболевания имеют аутоиммунную природу), а запуск патологического процесса происходит внешними триггерами окружающей среды (психо - эмоциональные стрессы, инфекции и пр) Обе патологии на данный момент неизлечимы, а лечение направлено на увеличение периодов ремиссии и на снижение тяжести болезни Показано, что на генетическом уровне обе патологии тесно связаны около пяти генетических локусов вовлечены как в развитие псориаза, так и болезни Крона В среднем псориазом страдает 3% мирового населения, причем имеется четкая регионально-этническая дифференциация распространенности заболевания с пиком среди европеоидных этнических групп В России и СНГ эпидемиологическая картина псориаза неполна, имеется всего несколько работ (Кешилева 3 Б, Оразымбетова Д А, Тимофеева Л Н, 2000, Джеткисбаева 3 С , Баткенова Г Р , 2002, Мордовцев В Н , Алиева П М , Сергеев А С , 2002, Пирузян Ан Л , 2005), но можно утверждать, что процент больных псориазом составляет не менее 3% Псориаз редко приводит к летальному исходу, однако существенно влияет на качество жизни пациентов и часто приводит к инвалидности В последнее время псориазом болеет все больше молодежи, что впоследствии скажется на потере трудоспособности части взрослого населения России, поэтому необходимо уже сейчас начинать разработку эффективных терапий и ранней диагностики псориаза
Болезнь Крона является тяжелой патологией Поражает около 0,15% населения, но, в отличие от псориаза, лечится только хирургически и приводит к инвалидности Чрезвычайно актуальна ранняя диагностика
болезни Крона, так как на данный момент диагноз ставится только при полостной операции кишечника Часто на поздних стадиях болезнь Крона переходит в онкозаболевание Важно подчеркнуть, что среди внекишечных проявлений болезни Крона часто встречается псориаз
Так как обе выбранные патологии обусловлены разрегулированной работой генетического аппарата, то эффективным методом в разработке подходов для диагностики, лечения и создания лекарственных препаратов является поиск критических звеньев патологического процесса, а именно, генов-кандидатов и соответствующих белковых продуктов Если генетические исследования аутоиммунных заболеваний продвинулись в достаточной степени как в России, так и за рубежом, то применение постгеномных технологий с целью выявления биомаркеров и исследования патогенеза данных патологий остаются задачей ближайшего будущего К настоящему моменту, по существу, не опубликовано работ по комплексному использованию транскриптомики и протеомики для изучения псориаза и болезни Крона Благодаря стремительному развитию геномных и постгеномных технологий, пользуясь литературными источниками и базами данных, можно выделить известные ассоциированные с данными патологиями гены, на основании компьютерных исследований, составить карты и сети, содержащие гены-кандидаты, и выделить подпроцессы, которые могут являться критическими в развитии патологий Далее необходимо это экспериментально проверить с помощью стандартных молекулярно-биологических методов
Цель работы провести поиск и изучить экспрессию генов-кандидатов при аутоиммунных заболеваниях на примере псориаза и болезни Крона
Задачи
1 С использованием методов информационной биологии
определить круг генов-кандидатов патогенеза при псориазе и болезни
Крона
2 Разработать основу для создания микрочипов быстрого
скрининга генотипа и установления фенотипа Для этого
- провести сбор информационного и клинического материала у здоровых индивидуумов и пациентов с псориазом,
определить фенотип ацетилирования и особенности распределения фенотипа ацетилирования в группах здоровых индивидуумов и пациентов с псориазом,
Изучить ассоциацию полиморфизма гена NAT2 с псориазом
Изучить изменение экспрессии генов ВАХ, BCL-2, CASP3 и р53 при псориазе
Провести сравнительный анализ данных экспрессии генов ВАХ, BCL-2, CASP3 и р53 в коже больных псориазом до и после лечения пациентов
Научная новизна работы
Впервые на основе анализа информационного материала при помощи программы «MetaCore» компании GENEGO Inc (США) определены общие гены-маркеры патологического процесса при псориазе и болезни Крона, белки которых могут рассматриваться как потенциальные мишени для подбора индивидуализированной лекарственной терапии
Впервые изучена активность каспазы-3 в пораженной и непораженной коже больных псориазом до и после лечения пациента иммуномодулирующим препаратом
Практическая значимость.
Данные, полученные при анализе экспрессии генов-кандидатов патогенеза при псориазе и болезни Крона, могут способствовать разработке новых диагностикумов и идентификации новых мишеней лекарственных препаратов для лечения псориаза и болезни Крона
Апробация результатов работы
Результаты работы были представлены на научно-практических конференциях в Минске «Молекулярная генетика, геномика и биотехнология» 2004, Гурзуфе - «1Т+М&Ес'2005» в 2005г, на Конференции «Генетика в XXI веке современное состояние и перспективы развития», Москва 2004 г и на 4-ом съезде Европейской ассоциации дерматовенерологов в 2006г в Финляндии
Структура и объем диссертации.
